子母穿梭式貨架系統有兩種出入庫方式，一是單側入庫單側出庫，二是均在一側，這兩張方式分別有各自的優缺點。穿梭式貨架通過巷道式貨架與穿梭車組合，實現托盤貨物高密度半自動化儲存，根據貨物的存取端口布置，可分為先入先出模式(FIFO)和后入先出模式(LIFO)。

出入庫方式：單側入庫，單側出庫。

　　出入庫模式：先入先出模式(FIFO)， 入庫、出庫各配置一套提升與輸送系統;托盤從一端存入，由巷道另一端取出，實現先入先出。

　　優點：

　　1. 可以實現對物流的順序存取，符合一般物流要求;

　　2. 可以實現物流存取分區操作，優化現場管理。

　　缺點：

　　1. 貨架兩端均需要布置叉車通道;

　　2. 動態儲存使用率低于后入先出(LIFO)。

子母穿梭式貨架

出入庫方式：均在一側。

　　出入庫模式：單巷道內，后入先出模式(LIFO)，僅在貨架單側布置叉車通道，貨物僅從巷道單側存取。整體庫區，以巷道為單元，自由存取。

　　優點：

　　1. 僅在單側布置通道，可以最大限度的利用倉儲面積;

　　2. 更適合一般對物料進出順序要求低的場合。

　　缺點：

　　1. 不能實現對物料的順序出庫要求;

　　2. 不適用于對產品保質期要求較高的快速消費品存儲。